小孩子患有脑炎可能与病毒感染有关，如虫媒病毒、疱疹病毒、流行性腮腺病毒、巨细胞病毒、埃可病毒、脊髓灰质炎病毒以及麻疹病毒、黄热病毒等，都有可能导致孩子发病，出现发热、头痛的情况。
除了病毒感染之外，真菌感染也会导致孩子发病，出现相应的不适。如曲霉菌、酵母菌、组织胞浆菌、孢子丝菌、念珠球菌等，都是此病的高危因素，需要重视，做好防治，减少危害。
孩子免疫力低也会增加脑炎的发病几率，主要是因为免疫力低容易感染病菌，一旦某种病原菌侵入孩子体内，就会诱发疾病。所以说要想孩子远离此病，就要帮助他们提高免疫力，减少不良危害，保障孩子的健康。
如果孩子患有某种寄生虫病，在没有完全彻底治愈的情况下，也会诱发脑炎。如脑血吸虫病、恶性疟疾、脑阿米巴病、旋线毛虫病以及弓形体虫病、脑锥虫病等，都会继发脑炎，导致孩子不适。
