精囊炎急性发作期，可根据致病病菌选择合适的消炎抗菌类抗生素药物治疗，待炎症消退后应继续服用消炎药物2周，预防转变为慢性精囊炎，慢性精囊炎则需继续用药4周以上，以巩固疗效。
常用的消炎药有：阿莫西林、头孢克肟、头孢丙烯、头孢地尼、左氧氟沙星、氧氟沙星、莫西沙星等。
精囊炎出现血精的患者，且血精颜色较红时，可适当选用止血敏、止血芳酸等药物止血，有助于身体更快痊愈。
还有些患者需使用可减轻精囊腺充血水肿的药物帮助治疗，如乙烯雌酚，5-α还原酶抑制剂等。
若是精囊炎患者的病情较为严重，比如有脓肿、结石或其他合并症状者，则需要手术治疗。
