1.蛋白结构不同
水解奶粉和普通奶粉最主要的区别就是蛋白成分存在的方式不同，一般普通奶粉中的蛋白结构是完整的，而水解奶粉是经过水解工艺加工的蛋白，把完整的大分子蛋白进行切割，变成小分子的蛋白。
2.适合人群不同
普通奶粉适合没有家族过敏史，身体各项指标都正常的宝宝。水解奶粉适合对牛奶蛋白过敏或者乳糖不耐受的宝宝。水解程度不同，水解奶粉的适应人群也不一样。适度水解奶粉主要用于牛奶过敏的饮食预防，适合所有新生儿食用，与普通奶粉相比，营养成分相同，过敏原含量少。
3.口感不同
普通奶粉比水解奶粉的口感要好些，有的蛋白质经过水解之后会产生一些苦味物质，影响了自然的口感，特别是深度水解酪蛋白配方，部分水解奶粉比深度水解奶粉的味道要可口一些。
水解奶粉也被称为低敏奶粉，是采用先进的水解蛋白技术，将完整的大分子蛋白切碎，在胃中形成更软、更容易吸收的凝乳，所以更容易被宝宝脆弱的肠胃吸收，也更容易消化，有助于缓解宝宝各种消化不适的问题，适合肠道还没有发育完全的0-12个月大的宝宝。
无人工添加的乳蛋白部分水解配方具有轻微的苦味，这是因为水解技术工艺把配方奶粉中的完整蛋白分子分解成容易消化的小分子蛋白质所形成的天然味道。3-4个月大的宝宝味觉还没有发育成熟，所以不会发现味道的差别，一旦宝宝习惯了这个味道，一般都会接受并且持续到一岁左右。
水解蛋白奶粉是一种特殊的配方奶粉，和一般配方奶粉相比，水解蛋白奶粉能够有效防治宝宝过敏，预防宝宝长期便秘，避免宝宝腹泻的反复发生。有过敏症状的宝宝，应该在医生的指导下选择水解蛋白奶粉，而不是一般的分阶段配方奶粉。
