1、一般治疗：呼吸道隔离和氧疗。呼吸道隔离可避免患儿再感染和交叉感染，氧疗能够改善患儿身体组织缺氧，方法与一般肺炎相同。
2、抗生素。治疗支原体肺炎，可选用能抑制蛋白质合成的抗生素，包括大环内脂尖、四环素类、氯霉素类等。
3、对症处理
祛痰：可以使痰液变稀薄，及时排出，否则同样会增加细菌感染机会。但有效的祛痰剂很少，在使用祛痰剂的同时，可采用翻身、拍背、雾化、吸痰等方法帮助宝宝祛痰。
止咳：咳嗽是支原体肺炎最为明显的症状，频繁而剧烈的咳嗽会影响患儿的睡眠质量，不利于康复。可适当给予镇静剂。
平喘：对喘憋严重者，可选用支气管扩张剂，如茶碱、受体激动剂等。
