临床的牛奶蛋白过敏的影响主要在于皮肤、肠胃和呼吸气管。对牛奶蛋白过敏的宝宝的皮肤或身体会出现红疹、风疹或湿疹;至于气管上，婴孩多痰、打喷嚏、咳嗽或气喘的现象较为普遍。病婴肠胃道方面常有腹部绞痛、呕吐及腹泻，他们常在喂奶后哭闹不安，腹泻虽常见，但程度上有很大的差异。
注意：
牛奶蛋白过敏症反应所显示的症状因人而异，其症状可以发生在喝下牛奶后立刻产生过敏反应或经过数小时，甚至数天后才开始显示。一位过敏儿可以出现一种或以上的过敏症状，父母应立刻咨询医生。
1、长大后更易发生过敏性疾病
牛奶蛋白过敏的宝宝发生哮喘、过敏性鼻炎和湿疹等过敏性疾病的比例高，这种现象被称之为牛奶蛋白过敏宝宝的“过敏进程”。严重过敏的宝宝可能出现过敏性休克，甚至死亡。
2、生长发育迟缓，身高标准差明显低于同年龄的健康宝宝
如果宝宝的牛奶蛋白过敏没有得到及时的处理，宝宝很可能会因长期拒食、腹泻、呕吐、反流等原因出现营养不良而导致生长发育迟缓，身高、体重增长缓慢。
1、适度水解蛋白配方粉(部分水解)：用于预防和降低牛奶蛋白过敏的风险，不能用于诊断和治疗蛋白过敏!(如果要用于治疗，它也是在完全控制了症状之后，在最后的过渡阶段使用)。
2、深度水解蛋白配方粉：用于治疗轻-中度牛奶蛋白过敏，能解决80-90%左右的过敏情况。
3、氨基酸配方粉：可以用来诊断牛奶蛋白过敏，治疗严重的牛奶蛋白过敏首选。
注意：对于有严重牛奶蛋白过敏症状的宝宝，通常采取以下饮食顺序：
诊断：怀疑牛奶蛋白过敏：选择氨基酸配方粉+食物回避(2-4周)
巩固：过敏症状明显改善，坚持原治疗配方+回避牛奶食品(3-6月)
过渡：过敏症状缓解，3-6月没有反复，尝试逐步转换水解蛋白配方(深度水解蛋白->适度水解蛋白)
对非常严重过敏症状的宝宝，如有消化道出血，生长发育迟缓，全身大面积湿疹或者有其他重症表现的，建议使用氨基酸配方粉治疗6-12个月，甚至更长。
