食管扩张术是一种有效的治疗方法，近年用的气囊扩张替代了硬性扩张条。适用于膜状蹼较薄者的治疗。
若膜状蹼厚而坚韧，扩张无效，可切开食管，切除环形黏膜，再将食管黏膜对拢吻合。亦有在内镜下成功切除先天性食管蹼的报道。必要时术后继续扩张。
对继发于气管、支气管组织残存物的先天性食管狭窄和纤维肌肉肥厚型狭窄可行食管部分切除。狭窄段<3cm者，可于狭窄部分切除后，给予食管端端吻合，术中注意保护迷走神经与会咽神经。对于长段纤维肌肉肥厚引起的先天性食管狭窄，经扩张术无效可作代食管手术。如狭窄靠近胃食管连结部，可推荐作节段性切除后食管吻合术，并加作抗反流手术。后者常用的有改良Hill胃壁固定术、Nissen胃底折叠术等预防反流。Collis胃成形术也曾被报道是一种有效的处理食管缩短和术后胃食管反流的手术。
治疗注意事项
1、应多吃软食、流食，少吃油炸、坚硬的食物。饮食多元化：平时不挑食，从不同的食物中补充身体所需的营养。
2、先天性食管狭窄，经食管扩张治疗，大部分可获得满意的效果。手术治疗的长期效果也是满意的。
3、术后鼓励患者多饮水，使支架扩张到最佳状态。尽管狭窄处被支架撑开，但内径有限，一般都在14mm大小。因此嘱患者一周内以流食为主，以后可酌情进行半流食或软食，并将食物仔细咀嚼，少许慢慢咽下，切勿“狼吞虎咽”式进食，以免引起阻塞。
4、由于目前支架无“活瓣”作用，置放后很容易造成胃内容物的反流，引起严重的反流性食管炎，继之发生食管溃疡并发出血及吸入性肺炎，因此，嘱患者在进食前要保持相当时间的直立体位(30min左右)，睡眠时床头抬高15°～30°，以防反流。
5、食管狭窄扩张术的术后护理不当极易引起食管穿孔，这是非常严重的。护理时应注意患者饮食，还有心理调节。尽量让患者食用一些软的食物，清淡的食物。
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