患儿造血所需原料如蛋白质、铁、维生素B12均易缺乏，故易患贫血。常见者为缺铁性贫血。
各种维生素及微量元素缺乏，尤以维生素A、B及C缺乏较常见。由于生长迟缓，钙、磷需要较少，因之继发严重的维生素D缺乏较为少见，但如患者先患佝偻病，后患营养不良则二者可同时存在。近年来发现严重营养不良常伴铁、锌、铜、硒缺乏，尤以锌缺乏明显。曾柏锦等报道，重度营养不良73.2%伴低血锌。
最常见为腹泻、肺炎以及各种感染。易继发支气管肺炎、腹泻、结核病、中耳炎、尿路感染及败血症等各种感染，特别是婴幼儿腹泻可迁延不愈，常伴电解质紊乱，如此形成恶性循环，更加重了营养不良。
迁延不愈的患儿有时可突然发生自发性低血糖，表现为体温不升，面色灰白，神志不清，脉搏缓慢乃至呼吸暂停，但无抽搐，若不及时静脉注射葡萄糖溶液，可因呼吸暂停而死亡。
注意事项
1、患儿的预后取决于营养不良的程度，发病的时间，有无合并症以及治疗是否得当。
2、疾病发病愈早，程度愈重且合并感染者预后越差。
3、胎儿期营养不良其后果可延续到婴儿期乃至终身；不仅影响到体格生长还可影响到日后小儿的认知及行为。
4、本病预后相对比恶性营养不良为好，住院病死率约在1%～2%。
5、年长儿稍高，恢复较慢。婴幼儿时期患营养不良性消瘦，若持续数月以上，可留下远期不良后果，如身材矮小和大脑生长发育受影响。
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