维生素B3可通过多种途径影响脂蛋白的代谢，其主要作用为降低极低密度脂蛋白(VLDL)的产生，抑制脂肪水解，降低血浆游离脂肪酸水平，从而降低肝脏胆固醇的合成和转运，降低血中甘油叁酯和胆固醇的水平。若血浆VLDL降低，低密度脂蛋白(LDL)的水平也随之缓慢下降。临床上多用于治疗动脉粥样硬化、缺血性心脏病、血栓堵塞性疾病;用于防治高胆固醇血症、高甘油叁酯血症、糖尿病、关节炎和白内障等疾病。
一则系统性文献回顾及统合迴归分析(meta-regression，包含11则研究，参与者9,959 人)指出，维生素B3不论是单独使用或搭配降脂药物，皆有助降低心血管疾病事件(但中风事件较无显着关联)。作者提到，这些改变与调节胆固醇无关，可能与维生素B3具有的调控发炎介质(C反应蛋白、磷脂酶A)，抑制致粥样硬化趋化因子，增加保护血管的荷尔蒙：脂联素有关。
维生素B3是NAD与NADP的重要成分，经还塬反应后可形成NAD(P)H，是细胞进行氧化还塬反应过程的重要辅酶，这些辅助因子的还塬态为强效抗氧化剂，极可能具备氧化还塬的调控机制(redox regulation mechanism)，可影响许多组织的功能，有些临床研究发现长期涂抹维生素B3，可改善皮肤的老化现象。
补充维生素B3很可能有助于预防某些复杂的出生缺陷。维生素B3可以补偿孕妇身体内的烟酰胺腺嘌呤二核苷酸(NAD)，进而预防相关出生缺陷的发生。在这项最新的研究中，研究人员首次将维生素B3的补充与健康人胎儿的发育相关联。
